由于中緬邊境地理位置特殊,高危人群種類較多,包括靜脈吸毒人群(IDUs)、性工作者(CSWs)、長途卡車司機(LDTDs)等,使得中緬邊境成為HIV-1感染和傳播的重災(zāi)區(qū)。另外,高危人群在中緬兩地來回往返活動,加劇了HIV-1在中緬兩國之間的雙向傳播,促進了HIV-1遺傳多樣性即重組的產(chǎn)生。
中國科學(xué)院昆明動物研究所動物模型與人類疾病機理重點實驗室鄭永唐研究員學(xué)科組前期對中緬邊境的IDUs和跨邊境的緬甸籍LDTDs進行了HIV-1分子流行病學(xué)研究表明,HIV-1在這些人群中流行種類多樣,尤其是重組頻繁(AIDS, 2012; BMC Infect Dis, 2014)。
但這些結(jié)果都是基于HIV-1部分基因片段而非全長或近乎全長基因組進行分析所得,而近乎全長基因組將更能清晰、準確地反映HIV-1的重組情況。
為充分掌握中緬邊境HIV-1的遺傳多樣性,在鄭永唐研究員的指導(dǎo)下,周衍衡博士對一例來自跨境的緬甸籍LDTD進行了HIV-1近乎全長基因組分析,結(jié)果顯示:這是一例HIV-1 CRF01_AE/B/C重組病毒株,與之前報道的東南亞所有重組株的重組位點均不相同,并與之前一株曾認為是最為復(fù)雜的來自緬甸CSW的HIV-1重組病毒株相比更為復(fù)雜。
該HIV-1CRF01_AE/B/C重組病毒株具有14個重組位點,含有4個CRF01-AE亞型片段,6個B亞型片段、5個C亞型片段。這也是繼Takebe等人在2003年報道緬甸HIV-1病毒株近乎全長基因組12年之后的首次報道。這些結(jié)果提示緬甸籍LDTDs中HIV-1重組模式復(fù)雜,也暗示中緬邊境HIV-1可能比現(xiàn)有報道的更為復(fù)雜多樣。本研究為進一步深入研究中緬邊境地區(qū)HIV-1的分子流行病學(xué)提供了方法導(dǎo)向,并能為如疫苗設(shè)計等相關(guān)的基礎(chǔ)研究提供序列參考。