中國科學(xué)家自主完成首個(gè)果樹作物基因組序列圖譜
海都閩南網(wǎng)訊 中新社武漢3月21日電 (記者 艾啟平)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)21日對外公布一項(xiàng)重大科研成果：由該校中國工程院院士鄧秀新領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)完成了甜橙基因組拼接與注釋，獲得了較高質(zhì)量的甜橙基因組。這是中國自主完成的首個(gè)果樹作物基因組序列圖譜，也是目前全球最完整的甜橙基因組圖譜。
柑橘是世界重要的果樹之一，而甜橙是世界第一大柑橘類型，其產(chǎn)量占全世界柑橘產(chǎn)量的60%左右。中國是世界上重要的柑橘原生中心，從2008年起，無論是從種植總面積還是總產(chǎn)量，中國已經(jīng)超越巴西成為世界柑橘第一大生產(chǎn)國。
專家稱，甜橙具有多胚、遺傳背景高度雜合等特點(diǎn)，阻礙了遺傳學(xué)及育種發(fā)展。完整的基因組信息，作為一個(gè)遺傳框架，將為柑橘遺傳與育種改良提供依據(jù)。
據(jù)介紹，甜橙基因組計(jì)劃于2011年啟動(dòng)。該基因組測序采用全基因組鳥槍法策略，分別構(gòu)建了多個(gè)不同插入片段長度的文庫，進(jìn)行雙末端測序。拼裝后的序列覆蓋87%的柑橘基因組，獲得注釋的基因約3萬個(gè)。通過遺傳標(biāo)記和染色體原位雜交分析，將基因組序列整合到9條染色體。專家研究發(fā)現(xiàn)，甜橙基因組中有51%的基因位點(diǎn)處于雜合狀態(tài)。
鄧秀新院士介紹，甜橙基因組的完成，將為國內(nèi)外同行研究蕓香科(柑橘)的特殊生物學(xué)性狀、功能基因組提供重要平臺(tái)。同時(shí)，對于果實(shí)包括色、香、味、成熟期等重要性狀基因的發(fā)掘及品種改良具有重要意義。這一重要成果發(fā)表在http://citrus.hzau.edu.cn網(wǎng)站上，為國內(nèi)外學(xué)術(shù)研究提供免費(fèi)數(shù)據(jù)分析。
目前，果樹作物包括葡萄、番木瓜、蘋果、草莓、可可、椰棗等基因組，國際上已發(fā)表。國際柑橘基因組計(jì)劃2003年啟動(dòng)，2011年1月釋放了克里曼丁橘的基因組草圖。但克里曼丁橘主要在地中海地區(qū)栽培，其產(chǎn)量只占柑橘總產(chǎn)量10%。因此，美國、巴西和中國等國科學(xué)家都期望獲得高質(zhì)量的甜橙基因組圖譜。
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